In questo elenco i fondi pre-unitari sono ripartiti in:
- Fondi di istituzioni politiche e di governo
- Fondi di istituzioni amministrative
- Fondi di istituzioni giudiziarie
Questa disposizione riflette la collocazione materiale dei fondi pre-unitari nei depositi dell'Archivio di Stato di Firenze, così come si è andata definendo nel corso del XIX secolo ed è stata riproposta nella nuova sede di Piazza Beccaria. Tale ordine fu esemplato sulle base delle funzioni cardine dell'ordinamento statuale (legislativa, esecutiva, giudiziaria) per quanto esse potevano essere riconoscibili all'interno di sistemi politici che non contemplavano la moderna divisione dei poteri. In questo ordinamento si possono tuttora leggere gli esiti del processo di concentrazione e trasmissione degli archivi che precedette l'istituzione dell'Archivio Centrale di Stato nel 1852.
Per un approfondimento di queste tematiche confronta: in Rassegna degli Archivi di Stato, XLVII/2-3 (mag./dic. 1987), Roma, 1988 - Riflessioni sul censimento generale dei fondi dell'Archivio di Stato di Firenze, di Paola Benigni, Orsola Campanile, Irene Cotta, Francesca Klein, Stefano Vitali, a pag. 406 e segg. - Il problema dell'ordinamento dell'Archivio di Stato di Firenze: precedenti storici e prospettive, di Vanna Arrighi, Anna Bellinazzi, Alessandra Contini Bonacossi, Loredana Maccabruni, Francesco Martelli, Diana Toccafondi, Carlo Vivoli, a pag. 437 e segg.
